Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR1P25024 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR1P25024 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCR1P25024 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR1P25024 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms