Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD9P21926 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD9P21926 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD9P21926 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD9P21926 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD9P21926 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD9P21926 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD9P21926 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD9P21926 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD9P21926 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD9P21926 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD9P21926 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD9P21926 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD9P21926 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD9P21926 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD9P21926 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD9P21926 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD9P21926 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD9P21926 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD9P21926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD9P21926 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CD9P21926 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD9P21926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD9P21926 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD9P21926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD9P21926 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD9P21926 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD9P21926 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD9P21926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD9P21926 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD9P21926 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CD9P21926 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD9P21926 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD9P21926 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD9P21926 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD9P21926 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD9P21926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD9P21926 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD9P21926 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD9P21926 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD9P21926 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD9P21926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD9P21926 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD9P21926 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD9P21926 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD9P21926 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD9P21926 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD9P21926 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD9P21926 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD9P21926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD9P21926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD9P21926 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD9P21926 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD9P21926 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD9P21926 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD9P21926 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD9P21926 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CD9P21926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD9P21926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD9P21926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD9P21926 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD9P21926 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD9P21926 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD9P21926 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD9P21926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD9P21926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD9P21926 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD9P21926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CD9P21926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD9P21926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD9P21926 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD9P21926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD9P21926 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD9P21926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD9P21926 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD9P21926 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD9P21926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD9P21926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD9P21926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms