Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR1P18146 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR1P18146 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR1P18146 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR1P18146 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR1P18146 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR1P18146 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR1P18146 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR1P18146 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR1P18146 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR1P18146 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR1P18146 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR1P18146 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR1P18146 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR1P18146 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR1P18146 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR1P18146 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR1P18146 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGR1P18146 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGR1P18146 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGR1P18146 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR1P18146 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR1P18146 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR1P18146 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR1P18146 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EGR1P18146 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EGR1P18146 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR1P18146 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR1P18146 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR1P18146 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR1P18146 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR1P18146 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR1P18146 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR1P18146 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR1P18146 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR1P18146 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR1P18146 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR1P18146 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR1P18146 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR1P18146 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR1P18146 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR1P18146 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR1P18146 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR1P18146 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR1P18146 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR1P18146 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR1P18146 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGR1P18146 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGR1P18146 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGR1P18146 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EGR1P18146 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EGR1P18146 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGR1P18146 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGR1P18146 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EGR1P18146 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGR1P18146 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR1P18146 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EGR1P18146 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR1P18146 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR1P18146 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR1P18146 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms