Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
KCNA6P17658 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KCNA6P17658 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KCNA6P17658 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
KCNA6P17658 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KCNA6P17658 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KCNA6P17658 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms