Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATA1P15976 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATA1P15976 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATA1P15976 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATA1P15976 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATA1P15976 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GATA1P15976 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATA1P15976 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATA1P15976 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATA1P15976 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATA1P15976 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATA1P15976 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATA1P15976 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATA1P15976 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATA1P15976 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GATA1P15976 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA1P15976 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA1P15976 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA1P15976 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA1P15976 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA1P15976 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA1P15976 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA1P15976 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA1P15976 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA1P15976 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA1P15976 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA1P15976 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA1P15976 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA1P15976 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA1P15976 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATA1P15976 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATA1P15976 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA1P15976 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA1P15976 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA1P15976 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA1P15976 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATA1P15976 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATA1P15976 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATA1P15976 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms