Protein–RNA interactions for Protein: P0CW71

HSMCR30, Putative metaphase chromosome protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSMCR30P0CW71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSMCR30P0CW71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSMCR30P0CW71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSMCR30P0CW71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSMCR30P0CW71 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms