Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFTA3P0C7M3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFTA3P0C7M3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTA3P0C7M3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFTA3P0C7M3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTA3P0C7M3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTA3P0C7M3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTA3P0C7M3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms