Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MGPP08493 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MGPP08493 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MGPP08493 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGPP08493 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGPP08493 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGPP08493 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGPP08493 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGPP08493 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGPP08493 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGPP08493 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGPP08493 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGPP08493 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGPP08493 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGPP08493 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGPP08493 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGPP08493 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGPP08493 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGPP08493 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGPP08493 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGPP08493 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGPP08493 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGPP08493 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGPP08493 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGPP08493 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MGPP08493 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MGPP08493 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MGPP08493 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MGPP08493 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MGPP08493 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MGPP08493 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MGPP08493 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MGPP08493 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MGPP08493 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MGPP08493 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MGPP08493 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MGPP08493 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MGPP08493 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MGPP08493 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MGPP08493 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MGPP08493 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MGPP08493 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MGPP08493 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MGPP08493 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MGPP08493 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms