Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPN1P04843 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RPN1P04843 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPN1P04843 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPN1P04843 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPN1P04843 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPN1P04843 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPN1P04843 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPN1P04843 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPN1P04843 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPN1P04843 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPN1P04843 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPN1P04843 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPN1P04843 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPN1P04843 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPN1P04843 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPN1P04843 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPN1P04843 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPN1P04843 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPN1P04843 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPN1P04843 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPN1P04843 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPN1P04843 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPN1P04843 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPN1P04843 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPN1P04843 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPN1P04843 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPN1P04843 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPN1P04843 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPN1P04843 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPN1P04843 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPN1P04843 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPN1P04843 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPN1P04843 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPN1P04843 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPN1P04843 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPN1P04843 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPN1P04843 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPN1P04843 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPN1P04843 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPN1P04843 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPN1P04843 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPN1P04843 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPN1P04843 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPN1P04843 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPN1P04843 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPN1P04843 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPN1P04843 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPN1P04843 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RPN1P04843 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPN1P04843 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPN1P04843 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPN1P04843 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPN1P04843 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPN1P04843 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPN1P04843 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPN1P04843 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPN1P04843 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPN1P04843 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPN1P04843 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPN1P04843 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPN1P04843 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPN1P04843 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPN1P04843 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPN1P04843 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPN1P04843 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPN1P04843 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPN1P04843 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPN1P04843 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPN1P04843 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPN1P04843 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPN1P04843 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RPN1P04843 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPN1P04843 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPN1P04843 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPN1P04843 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPN1P04843 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPN1P04843 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPN1P04843 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPN1P04843 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPN1P04843 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPN1P04843 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms