Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4AP04350 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBB4AP04350 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB4AP04350 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB4AP04350 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBB4AP04350 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB4AP04350 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms