Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTA1P02549 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTA1P02549 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTA1P02549 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms