Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-DQB1P01920 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-DQB1P01920 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DQB1P01920 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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