Protein–RNA interactions for Protein: P01024

C3, Complement C3, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3P01024 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
C3P01024 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
C3P01024 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
C3P01024 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
C3P01024 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
C3P01024 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
C3P01024 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
C3P01024 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
C3P01024 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
C3P01024 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
C3P01024 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
C3P01024 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
C3P01024 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
C3P01024 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
C3P01024 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
C3P01024 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
C3P01024 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
C3P01024 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
C3P01024 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
C3P01024 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
C3P01024 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
C3P01024 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
C3P01024 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
C3P01024 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
C3P01024 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
C3P01024 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
C3P01024 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
C3P01024 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
C3P01024 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
C3P01024 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
C3P01024 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
C3P01024 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
C3P01024 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
C3P01024 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
C3P01024 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C3P01024 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
C3P01024 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
C3P01024 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
C3P01024 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
C3P01024 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
C3P01024 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
C3P01024 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
C3P01024 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
C3P01024 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
C3P01024 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
C3P01024 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
C3P01024 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
C3P01024 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
C3P01024 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
C3P01024 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
C3P01024 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
C3P01024 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
C3P01024 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
C3P01024 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
C3P01024 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
C3P01024 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C3P01024 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
C3P01024 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
C3P01024 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
C3P01024 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
C3P01024 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
C3P01024 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
C3P01024 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
C3P01024 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
C3P01024 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
C3P01024 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
C3P01024 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
C3P01024 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
C3P01024 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
C3P01024 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
C3P01024 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
C3P01024 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
C3P01024 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
C3P01024 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
C3P01024 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
C3P01024 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
C3P01024 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
C3P01024 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
C3P01024 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
C3P01024 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
C3P01024 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
C3P01024 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
C3P01024 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
C3P01024 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
C3P01024 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
C3P01024 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
C3P01024 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
C3P01024 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
C3P01024 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
C3P01024 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
C3P01024 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
C3P01024 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
C3P01024 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
C3P01024 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
C3P01024 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
C3P01024 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
C3P01024 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
C3P01024 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
C3P01024 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
C3P01024 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms