Protein–RNA interactions for Protein: P00439

PAH, Phenylalanine-4-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAHP00439 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAHP00439 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAHP00439 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAHP00439 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAHP00439 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAHP00439 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAHP00439 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAHP00439 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAHP00439 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAHP00439 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAHP00439 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAHP00439 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAHP00439 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAHP00439 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAHP00439 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAHP00439 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAHP00439 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAHP00439 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAHP00439 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAHP00439 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAHP00439 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAHP00439 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAHP00439 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAHP00439 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAHP00439 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAHP00439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAHP00439 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAHP00439 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAHP00439 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAHP00439 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAHP00439 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAHP00439 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAHP00439 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAHP00439 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAHP00439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAHP00439 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAHP00439 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAHP00439 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAHP00439 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAHP00439 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAHP00439 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAHP00439 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAHP00439 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAHP00439 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAHP00439 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAHP00439 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAHP00439 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAHP00439 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAHP00439 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAHP00439 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAHP00439 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAHP00439 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAHP00439 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAHP00439 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAHP00439 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAHP00439 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAHP00439 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAHP00439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAHP00439 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAHP00439 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAHP00439 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAHP00439 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAHP00439 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAHP00439 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms