Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF3O95398 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RAPGEF3O95398 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF3O95398 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
RAPGEF3O95398 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
RAPGEF3O95398 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RAPGEF3O95398 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms