Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRATO95237 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRATO95237 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRATO95237 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRATO95237 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRATO95237 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRATO95237 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRATO95237 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRATO95237 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRATO95237 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRATO95237 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRATO95237 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRATO95237 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRATO95237 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRATO95237 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRATO95237 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRATO95237 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRATO95237 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRATO95237 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRATO95237 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRATO95237 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRATO95237 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRATO95237 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRATO95237 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRATO95237 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRATO95237 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRATO95237 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRATO95237 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRATO95237 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRATO95237 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRATO95237 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRATO95237 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRATO95237 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRATO95237 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRATO95237 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRATO95237 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRATO95237 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRATO95237 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRATO95237 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRATO95237 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRATO95237 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRATO95237 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRATO95237 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRATO95237 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRATO95237 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRATO95237 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRATO95237 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRATO95237 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRATO95237 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRATO95237 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRATO95237 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRATO95237 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRATO95237 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRATO95237 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRATO95237 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRATO95237 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRATO95237 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRATO95237 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRATO95237 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRATO95237 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRATO95237 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRATO95237 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRATO95237 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRATO95237 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRATO95237 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRATO95237 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRATO95237 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRATO95237 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRATO95237 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRATO95237 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRATO95237 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRATO95237 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRATO95237 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRATO95237 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRATO95237 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms