Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24DO94855 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24DO94855 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24DO94855 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms