Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDKL5O76039 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDKL5O76039 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDKL5O76039 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDKL5O76039 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDKL5O76039 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms