Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX3O60493 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX3O60493 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX3O60493 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX3O60493 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX3O60493 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX3O60493 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX3O60493 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX3O60493 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX3O60493 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX3O60493 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX3O60493 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX3O60493 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX3O60493 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX3O60493 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX3O60493 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX3O60493 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX3O60493 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX3O60493 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX3O60493 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX3O60493 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX3O60493 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX3O60493 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX3O60493 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX3O60493 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX3O60493 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX3O60493 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX3O60493 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX3O60493 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX3O60493 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX3O60493 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX3O60493 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX3O60493 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX3O60493 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX3O60493 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX3O60493 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX3O60493 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX3O60493 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX3O60493 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX3O60493 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX3O60493 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX3O60493 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX3O60493 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX3O60493 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX3O60493 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX3O60493 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX3O60493 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX3O60493 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX3O60493 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX3O60493 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX3O60493 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX3O60493 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX3O60493 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX3O60493 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX3O60493 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX3O60493 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX3O60493 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX3O60493 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX3O60493 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX3O60493 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX3O60493 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX3O60493 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX3O60493 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX3O60493 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX3O60493 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX3O60493 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX3O60493 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX3O60493 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX3O60493 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX3O60493 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX3O60493 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX3O60493 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX3O60493 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX3O60493 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX3O60493 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX3O60493 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX3O60493 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX3O60493 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX3O60493 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX3O60493 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX3O60493 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX3O60493 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX3O60493 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX3O60493 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX3O60493 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX3O60493 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX3O60493 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX3O60493 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms