Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHADO15335 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHADO15335 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHADO15335 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHADO15335 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHADO15335 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHADO15335 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHADO15335 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHADO15335 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHADO15335 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHADO15335 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHADO15335 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHADO15335 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHADO15335 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHADO15335 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHADO15335 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHADO15335 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHADO15335 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHADO15335 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHADO15335 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHADO15335 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHADO15335 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHADO15335 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHADO15335 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHADO15335 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHADO15335 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHADO15335 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHADO15335 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHADO15335 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHADO15335 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHADO15335 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHADO15335 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHADO15335 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHADO15335 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHADO15335 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHADO15335 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHADO15335 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHADO15335 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHADO15335 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHADO15335 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHADO15335 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHADO15335 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHADO15335 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHADO15335 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHADO15335 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHADO15335 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHADO15335 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHADO15335 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHADO15335 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHADO15335 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHADO15335 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHADO15335 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHADO15335 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHADO15335 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHADO15335 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHADO15335 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHADO15335 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHADO15335 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHADO15335 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHADO15335 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHADO15335 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHADO15335 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHADO15335 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHADO15335 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHADO15335 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHADO15335 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHADO15335 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHADO15335 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHADO15335 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHADO15335 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHADO15335 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHADO15335 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHADO15335 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHADO15335 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHADO15335 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHADO15335 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHADO15335 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHADO15335 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHADO15335 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHADO15335 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHADO15335 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHADO15335 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHADO15335 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHADO15335 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHADO15335 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHADO15335 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms