Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPB6O14558 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB6O14558 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB6O14558 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB6O14558 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB6O14558 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB6O14558 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB6O14558 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HSPB6O14558 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB6O14558 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB6O14558 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB6O14558 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB6O14558 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB6O14558 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB6O14558 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB6O14558 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB6O14558 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB6O14558 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB6O14558 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB6O14558 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPB6O14558 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB6O14558 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB6O14558 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPB6O14558 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSPB6O14558 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.2 ms