Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP2O00295 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP2O00295 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP2O00295 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP2O00295 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP2O00295 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP2O00295 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TULP2O00295 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP2O00295 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP2O00295 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP2O00295 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP2O00295 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP2O00295 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP2O00295 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP2O00295 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP2O00295 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP2O00295 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP2O00295 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP2O00295 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TULP2O00295 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP2O00295 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP2O00295 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP2O00295 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP2O00295 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP2O00295 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP2O00295 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP2O00295 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP2O00295 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP2O00295 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP2O00295 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP2O00295 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP2O00295 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP2O00295 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP2O00295 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP2O00295 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP2O00295 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP2O00295 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP2O00295 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TULP2O00295 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP2O00295 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP2O00295 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP2O00295 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP2O00295 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP2O00295 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP2O00295 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP2O00295 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP2O00295 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP2O00295 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP2O00295 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP2O00295 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP2O00295 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP2O00295 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP2O00295 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP2O00295 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP2O00295 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TULP2O00295 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP2O00295 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms