Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFXAPO00287 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFXAPO00287 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RFXAPO00287 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFXAPO00287 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms