Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFFAO00273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DFFAO00273 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DFFAO00273 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DFFAO00273 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DFFAO00273 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFFAO00273 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFFAO00273 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFFAO00273 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFFAO00273 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFFAO00273 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DFFAO00273 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DFFAO00273 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DFFAO00273 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DFFAO00273 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DFFAO00273 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DFFAO00273 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DFFAO00273 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DFFAO00273 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DFFAO00273 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DFFAO00273 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DFFAO00273 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DFFAO00273 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DFFAO00273 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DFFAO00273 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DFFAO00273 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DFFAO00273 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFFAO00273 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFFAO00273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFFAO00273 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DFFAO00273 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFFAO00273 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFFAO00273 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DFFAO00273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DFFAO00273 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DFFAO00273 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DFFAO00273 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DFFAO00273 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DFFAO00273 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DFFAO00273 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DFFAO00273 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DFFAO00273 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DFFAO00273 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DFFAO00273 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DFFAO00273 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DFFAO00273 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DFFAO00273 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DFFAO00273 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DFFAO00273 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DFFAO00273 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DFFAO00273 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DFFAO00273 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DFFAO00273 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DFFAO00273 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DFFAO00273 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DFFAO00273 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DFFAO00273 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DFFAO00273 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DFFAO00273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DFFAO00273 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DFFAO00273 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DFFAO00273 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DFFAO00273 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DFFAO00273 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms