Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD9O00233 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD9O00233 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD9O00233 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD9O00233 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms