Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B1O00203 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B1O00203 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B1O00203 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B1O00203 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms