Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C1C5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1C5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1C5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1C5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1C5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C1C5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C1C5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C1C5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C1C5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C1C5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C1C5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C1C5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C1C5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C1C5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C1C5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C1C5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C1C5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C1C5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C1C5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C1C5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H7C1C5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C1C5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C1C5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C1C5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H7C1C5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H7C1C5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C1C5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C1C5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C1C5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C1C5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H7C1C5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C1C5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H7C1C5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1C5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1C5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1C5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1C5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1C5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H7C1C5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1C5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1C5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1C5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H7C1C5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1C5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1C5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1C5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H7C1C5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H7C1C5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H7C1C5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H7C1C5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1C5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1C5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1C5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1C5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1C5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H7C1C5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1C5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1C5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1C5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1C5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C1C5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1C5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C1C5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C1C5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1C5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1C5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1C5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C1C5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1C5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1C5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms