Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
H3BQV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BQV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BQV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H3BQV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H3BQV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H3BQV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
H3BQV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H3BQV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H3BQV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
H3BQV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
H3BQV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H3BQV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H3BQV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H3BQV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H3BQV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
H3BQV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
H3BQV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
H3BQV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
H3BQV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BQV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BQV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
H3BQV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H3BQV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H3BQV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H3BQV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H3BQV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BQV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BQV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BQV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BQV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BQV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BQV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BQV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BQV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BQV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BQV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BQV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H3BQV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H3BQV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H3BQV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
H3BQV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H3BQV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H3BQV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
H3BQV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
H3BQV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
H3BQV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H3BQV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
H3BQV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
H3BQV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
H3BQV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BQV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BQV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BQV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BQV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BQV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BQV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
H3BQV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
H3BQV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H3BQV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H3BQV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H3BQV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H3BQV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BQV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
H3BQV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
H3BQV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
H3BQV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BQV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms