Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF878C9JN71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF878C9JN71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF878C9JN71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms