Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGB1P1B2RPK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB1P1B2RPK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB1P1B2RPK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HMGB1P1B2RPK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms