Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX3A6NHT5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX3A6NHT5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX3A6NHT5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms