Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRD1A4D1F6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRD1A4D1F6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRD1A4D1F6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms