Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC3H12DA2A288 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZC3H12DA2A288 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZC3H12DA2A288 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12DA2A288 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZC3H12DA2A288 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms