Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV48

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV48 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A087WV48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A087WV48 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A087WV48 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A087WV48 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A087WV48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A087WV48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A087WV48 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WV48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WV48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WV48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WV48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WV48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WV48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WV48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WV48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WV48 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WV48 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WV48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WV48 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WV48 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WV48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WV48 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WV48 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WV48 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WV48 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WV48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WV48 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WV48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WV48 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WV48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WV48 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WV48 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WV48 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WV48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WV48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WV48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WV48 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WV48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WV48 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WV48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WV48 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WV48 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WV48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WV48 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WV48 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087WV48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087WV48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WV48 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WV48 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WV48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WV48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WV48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WV48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WV48 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WV48 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WV48 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WV48 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WV48 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WV48 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WV48 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A087WV48 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WV48 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WV48 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WV48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WV48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WV48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WV48 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WV48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WV48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WV48 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WV48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WV48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms