Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCSO14618 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCSO14618 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCSO14618 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCSO14618 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCSO14618 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCSO14618 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCSO14618 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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