Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3CA6NKF2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms