Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCSO14618 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCSO14618 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCSO14618 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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