RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.68■■■■■ 4.9
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.15■■■■■ 4.02
CCDC71-201ENST00000321895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
CCDC71-201ENST00000321895 ABCC9O60706 1549 aa38.17■■■■□ 3.7
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.86■■■■□ 3.65
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.69■■■■□ 3.62
CCDC71-201ENST00000321895 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.59■■■■□ 3.61
CCDC71-201ENST00000321895 NACADO15069 1562 aa37.45■■■■□ 3.59
CCDC71-201ENST00000321895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.22■■■■□ 3.55
CCDC71-201ENST00000321895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.8■■■■□ 3.48
CCDC71-201ENST00000321895 SCRIBQ14160 1630 aa36.72■■■■□ 3.47
CCDC71-201ENST00000321895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.44■■■■□ 3.42
CCDC71-201ENST00000321895 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.06■■■■□ 3.36
CCDC71-201ENST00000321895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
CCDC71-201ENST00000321895 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.46■■■■□ 3.27
CCDC71-201ENST00000321895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CCDC71-201ENST00000321895 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.24■■■■□ 3.23
CCDC71-201ENST00000321895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
CCDC71-201ENST00000321895 SMARCA4P51532 1647 aa35.23■■■■□ 3.23
CCDC71-201ENST00000321895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CCDC71-201ENST00000321895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
CCDC71-201ENST00000321895 WIZO95785 1651 aa34.93■■■■□ 3.18
CCDC71-201ENST00000321895 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.86■■■■□ 3.17
CCDC71-201ENST00000321895 SMARCA2P51531 1590 aa34.76■■■■□ 3.15
CCDC71-201ENST00000321895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.73■■■■□ 3.15
CCDC71-201ENST00000321895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CCDC71-201ENST00000321895 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.6■■■■□ 3.13
CCDC71-201ENST00000321895 NCAPD3P42695 1498 aa34.53■■■■□ 3.12
CCDC71-201ENST00000321895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CCDC71-201ENST00000321895 HMGXB3Q12766 1538 aa34.49■■■■□ 3.11
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.19■■■■□ 3.06
CCDC71-201ENST00000321895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.98■■■■□ 3.03
CCDC71-201ENST00000321895 CFTRP13569 1480 aa33.63■■■□□ 2.97
CCDC71-201ENST00000321895 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.59■■■□□ 2.97
CCDC71-201ENST00000321895 PRDM2Q13029 1718 aa33.53■■■□□ 2.96
CCDC71-201ENST00000321895 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.51■■■□□ 2.95
CCDC71-201ENST00000321895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.46■■■□□ 2.95
CCDC71-201ENST00000321895 NESP48681 1621 aa33.38■■■□□ 2.93
CCDC71-201ENST00000321895 ABCC8Q09428 1581 aa33.31■■■□□ 2.92
CCDC71-201ENST00000321895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.21■■■□□ 2.91
CCDC71-201ENST00000321895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.2■■■□□ 2.9
CCDC71-201ENST00000321895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.18■■■□□ 2.9
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM41Q8WV44 630 aa33.17■■■□□ 2.9
CCDC71-201ENST00000321895 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.07■■■□□ 2.88
CCDC71-201ENST00000321895 SYNJ1O43426 1573 aa33.07■■■□□ 2.88
CCDC71-201ENST00000321895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.04■■■□□ 2.88
CCDC71-201ENST00000321895 TOP2BQ02880 1626 aa33.02■■■□□ 2.88
CCDC71-201ENST00000321895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.01■■■□□ 2.87
CCDC71-201ENST00000321895 CUX1P39880 1505 aa32.99■■■□□ 2.87
CCDC71-201ENST00000321895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.88■■■□□ 2.85
CCDC71-201ENST00000321895 ERCC6Q03468 1493 aa32.82■■■□□ 2.84
CCDC71-201ENST00000321895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
CCDC71-201ENST00000321895 TOPBP1Q92547 1522 aa32.81■■■□□ 2.84
CCDC71-201ENST00000321895 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.78■■■□□ 2.84
CCDC71-201ENST00000321895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.7■■■□□ 2.82
CCDC71-201ENST00000321895 WDR62O43379 1518 aa32.65■■■□□ 2.82
CCDC71-201ENST00000321895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
CCDC71-201ENST00000321895 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
CCDC71-201ENST00000321895 SOGA1O94964 1423 aa32.57■■■□□ 2.8
CCDC71-201ENST00000321895 EEA1Q15075 1411 aa32.55■■■□□ 2.8
CCDC71-201ENST00000321895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
CCDC71-201ENST00000321895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.46■■■□□ 2.79
CCDC71-201ENST00000321895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.45■■■□□ 2.79
CCDC71-201ENST00000321895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.44■■■□□ 2.78
CCDC71-201ENST00000321895 KIF27Q86VH2 1401 aa32.4■■■□□ 2.78
CCDC71-201ENST00000321895 WDR97A6NE52 1622 aa32.4■■■□□ 2.78
CCDC71-201ENST00000321895 CUX2O14529 1486 aa32.39■■■□□ 2.78
CCDC71-201ENST00000321895 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CCDC71-201ENST00000321895 IFT140Q96RY7 1462 aa32.32■■■□□ 2.76
CCDC71-201ENST00000321895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.31■■■□□ 2.76
CCDC71-201ENST00000321895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.23■■■□□ 2.75
CCDC71-201ENST00000321895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CCDC71-201ENST00000321895 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.14■■■□□ 2.74
CCDC71-201ENST00000321895 KIF21BO75037 1637 aa32.14■■■□□ 2.74
CCDC71-201ENST00000321895 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.13■■■□□ 2.73
CCDC71-201ENST00000321895 IGF1RP08069 1367 aa32.12■■■□□ 2.73
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
CCDC71-201ENST00000321895 PRXQ9BXM0 1461 aa32.08■■■□□ 2.73
CCDC71-201ENST00000321895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.08■■■□□ 2.73
CCDC71-201ENST00000321895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.05■■■□□ 2.721e-9■■■■■ 61.5
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA3Q08378 1498 aa32.04■■■□□ 2.72
CCDC71-201ENST00000321895 PBRM1Q86U86 1689 aa32.04■■■□□ 2.72
CCDC71-201ENST00000321895 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CCDC71-201ENST00000321895 CUL7Q14999 1698 aa32.02■■■□□ 2.72
CCDC71-201ENST00000321895 GRIN2BQ13224 1484 aa31.98■■■□□ 2.71
CCDC71-201ENST00000321895 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.96■■■□□ 2.71
CCDC71-201ENST00000321895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.96■■■□□ 2.71
CCDC71-201ENST00000321895 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.96■■■□□ 2.71
CCDC71-201ENST00000321895 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.84■■■□□ 2.69
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTS12P58397 1594 aa31.83■■■□□ 2.69
CCDC71-201ENST00000321895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
CCDC71-201ENST00000321895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.8■■■□□ 2.68
CCDC71-201ENST00000321895 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.78■■■□□ 2.68
CCDC71-201ENST00000321895 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
CCDC71-201ENST00000321895 SYNJ2O15056 1496 aa31.64■■■□□ 2.66
CCDC71-201ENST00000321895 CEP162Q5TB80 1403 aa31.61■■■□□ 2.65
CCDC71-201ENST00000321895 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.59■■■□□ 2.65
CCDC71-201ENST00000321895 GRIN2AQ12879 1464 aa31.58■■■□□ 2.65
CCDC71-201ENST00000321895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CCDC71-201ENST00000321895 CLIP1P30622 1438 aa31.49■■■□□ 2.63
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