Protein–RNA interactions for Protein: Q09MP3

RAD51AP2, RAD51-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51AP2Q09MP3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD51AP2Q09MP3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD51AP2Q09MP3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms