Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN7Q9Y6W3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN7Q9Y6W3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN7Q9Y6W3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN7Q9Y6W3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN7Q9Y6W3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms