Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPG1Q9Y678 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG1Q9Y678 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG1Q9Y678 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms