Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC1Q9Y5R8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC1Q9Y5R8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC1Q9Y5R8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms