Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKP3Q9Y446 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKP3Q9Y446 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP3Q9Y446 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP3Q9Y446 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms