Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC9Q9Y3B6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EMC9Q9Y3B6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC9Q9Y3B6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms