Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRG3Q9Y2Y8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG3Q9Y2Y8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRG3Q9Y2Y8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG3Q9Y2Y8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms