Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP11BQ9Y2G3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP11BQ9Y2G3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP11BQ9Y2G3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP11BQ9Y2G3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP11BQ9Y2G3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP11BQ9Y2G3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms