Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1Q9Y2A7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1Q9Y2A7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1Q9Y2A7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1Q9Y2A7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1Q9Y2A7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms