Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIGD1AQ9Y241 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIGD1AQ9Y241 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIGD1AQ9Y241 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIGD1AQ9Y241 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms