Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLQQ9Y215 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COLQQ9Y215 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLQQ9Y215 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COLQQ9Y215 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms