Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMK2AQ9UQM7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAMK2AQ9UQM7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAMK2AQ9UQM7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms